孟宪文，博士，副教授，硕士研究生导师。中国生物信息学学会（筹）多组学与整合生物学专业委员会委员。2013年获哈尔滨医科大学生物信息学学士学位，2018年获浙江大学生物信息学博士学位。2018年7月至今，在山东农业大学任教。共发表SCI论文30余篇，其中以第一作者或通讯作者身份发表学术论文8篇，副主编科学出版社“十四五”普通高等教育本科规划教材《生物信息学》（第四版）。担任Plant Cell，Nature Communications和Horticulture Research等多个国际期刊审稿人。近年来，主持国家自然科学基金委青年项目1项、国家重点研发子课题3项，合作育成农业农村部登记番茄品种1个。

研究方向：

1.       筛选优异番茄种质资源，开展基因组测序，绘制遗传变异图谱，逐步建立番茄“基因字典”；

2.       聚焦番茄灰霉病等重要病害，系统发掘关键抗病基因，利用遗传学、分子生物学、生物信息学等手段，解析番茄对常见病害抗性反应的分子机理。

教学工作：

承担本科生《植物智慧育种学2》、研究生《园艺生物信息学》等课程的教学任务。

主持项目：

1.       国家自然科学基金青年基金项目，32000364，基于多组学的番茄茉莉酸信号通路驯化机制研究，2021.01-2023.12，主持

2.       国家重点研发计划项目子课题，2019YFD1000305，浅根系构型番茄材料的创建与应用，2019.05-2022.12，主持

3.       国家重点研发计划项目子课题，2022YFD1201701，园艺作物种质资源耐盐碱和养分高效利用性状的精准鉴定，2022.12-2027.11，主持

4.       国家重点研发计划项目子课题，2023YFD1200101，园艺作物表型资源库构建， 2023.12-2028.11，主持

发表论文：

1.       李亚妮^#, 韩鸿宇^#, 耿梦爽, 米若兰, 王韦琪, 于文静, 孟宪文^*, 李传友^*. ChiC基因调控番茄灰霉病抗性的机制研究. 生物技术通报, 2026, doi: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2025-1242.

2.       Miaoshuang Zhang^#, Hongyu Han^#, Yani Li, Menghan Zhang, Jiajie Lian, Mengshuang Geng, Jiuhai Zhao, Qian Chen, Huawei Zhai, Xianwen Meng^*, and Chuanyou Li^*. Overexpression of DRM2 increases resistance to Botrytis cinerea by modulating JA signalling pathway in tomato. Plant Cell & Environment, 2025, 49(1): 226-239.

3.       Hongyu Han, Xiuhong Li, Tianze Li, Qian Chen, Jiuhai Zhao, Huawei Zhai, Lei Deng, Xianwen Meng^*, and Chuanyou Li^*. Chromosome-level genome assembly of Solanum pimpinellifolium. Scientific Data, 2024, 11 (1): 577.

4.       Wentao Yang^#, Huawei Zhai^#, Fangming Wu^#, Lei Deng^#*, Yu Chao, Xianwen Meng, Qian Chen, Chenhuan Liu, Xiaomin Bie, Chuanlong Sun, Yang Yu, Xiaofei Zhang, Xiaoyue Zhang, Zeqian Chang, Min Xue, Yajie Zhao, Xiangbing Meng, Boshu Li, Xiansheng Zhang, Dajian Zhang, Xiangyu Zhao, Caixia Gao, Jiayang Li, Chuanyou Li^*. Peptide REF1 is a local wound signal promoting plant regeneration. Cell, 2024, 187 (12): 3024-3038.

5.       Jian Liu^#, Chi Zhang^#, Heyao Sun^#, Yinqiang Zang, Xianwen Meng, Huawei Zhai, Qian Chen^*, Chuanyou Li^*. A natural variation in SlSCaBP8 promoter contributes to the loss of saline-alkaline tolerance during tomato improvement. Horticulture Research, 2024, 11 (4): uhae055.

6.       Lei Deng^#*, Tianxia Yang^#, Qian Li^#, Zeqian Chang^#, Chuanlong Sun, Hongling Jiang, Xianwen Meng, Tingting Huang, Chang-Bao Li, Silin Zhong, Chuanyou Li^*. Tomato MED25 regulates fruit ripening by interacting with EIN3-like transcription factors. Plant Cell, 2023, 35 (3): 1038-1057.

7.       Tianli Tu^#, Shuangshuang Zheng^#, Panrong Ren, Xianwen Meng, Jiuhai Zhao, Qian Chen^*, Chuanyou Li^*. Coordinated cytokinin signaling and auxin biosynthesis mediates arsenate-induced root growth inhibition. Plant Physiology, 2021, 185 (3): 1166-1181.

8.       Jingjing Wang, Xianwen Meng, Oxana B. Dobrovolskaya, Yuriy L. Orlov, Ming Chen^*. Non-coding RNAs and their roles in stress response in plants. Genomics, Proteomics & Bioinformatics, 2017, 15(5): 301-312.

9.       Chunhui Yuan^#, Xianwen Meng^#, Xue Li, Nicola Illing, Robert A. Ingle, Jingjing Wang, Ming Chen^*. PceRBase: a database of plant competing endogenous RNA. Nucleic Acids Research, 2017, 45(D1): D1009-D1014.

10.   Xianwen Meng, Xue Li, Peijing Zhang, Jingjing Wang, Yincong Zhou, Ming Chen^*. Circular RNA: an emerging key player in RNA world. Briefings in Bioinformatics, 2016, 18(4): 547-557.

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